万州食品经营许可证的办理流程主要包括以下几个步骤：
一、准备相关材料
在申请食品经营许可证前，需要准备以下材料：
食品经营许可申请书；
营业执照或者其他主体资格证明文件复印件；
与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件；
食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等食品安全的规章制度；
如果是利用自动售货设备从事食品销售，还需提交自动售货设备的产品合格证明、具体放置地点，经营者名称、住所、联系方式、食品经营许可证的公示方法等材料。
二、提交申请并现场核查
准备好相关材料后，向申请人所在地设区市或者县级食品监督管理部门提交申请。食品监督管理部门会对申请材料进行审查，并可能会对申请人的生产经营场所进行现场核查，以确保符合食品生产经营的条件。

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